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总而言之，科学家们得到的结论决不可能是完全的正确，只能说是针对于目前所能观察到的事物范围内的某些现象，他们作了某一个层次上的比较适合的解释，超出了这个层次和范围对于科学家们来说也只能说是假设臆测或者根本就是无知。比如在我们这个复杂的世界上，由于不同众生的种种业力而显现的各种奇奇怪怪的现象，科学对于这方面的事例就是很难于解释的。比如佛教中所讲的八种共同一般性的成就，也就是通过禅定修持有瑜珈修证的人，可以显示很多的神变，比如入水不沈、自由飞行于天空，以及直接无碍地穿越巨石山崖等等，对于这些现象，科学家们也是没有办法解释，最多只是加上一个特异功能的名字而已。尤其是涉及到佛教密法中所讲的一些不共同特别殊胜的大成就，结果是修行者连自己身体一点也不剩下，在七天之中全部化成虹光而消逝，科学家对此通过假设而推断出一些结论，比如是身体通过什么物质而产生发光现象，但这显然存在著许多漏洞，不深入研究佛学，他们是没有办法完全了知的。
实际上，在我们这个人类社会上，科学家还没有解决的问题是非常地多，比如说人类内心的痛苦和世间上的各种灾难，科学家也没有办法解除。而对于佛教中所说的人类精神或是心灵的奥妙，即使是对当今最著名的那些科学家来说，也是如堕云雾，难于明白其真相。
在广阔无边浩瀚的宇宙世界中，各种形形色色的现象无穷无尽，科学未知的事物数也数不清。即使在科学家们所熟悉的现象和研究领域内，虽然在当今科学昌明的时代，科学不能解释的也非常多。比如在1980年5月19日，美国有个叫新银歌兰的地方，在上午10点的时候，天空突然完全变成黑暗，就像被乌云整个笼罩一般暗无天日，直到第二天早上，但当时并未发生任何日食或其他什么原因，物理学家们虽然经过深入调查研究但仍迷惑不解。还有最近在印度中部有一个叫曼都那的地方，突然降下了很多珍珠雨，人们捡到这些珍珠后都戴在身上以作装饰品，当时新闻媒体也报道过，震动了有关方面，一些国家的天文学家大气物理学家等很多专门学科的专家都对这事作了详细的观察研究，但始终找不到一个令公众满意的结论。另外比较出名的世界上公认的也有好几大谜，所以英国著名的物理化学家法拉第曾经也这样说过：科学不能完全解决一切事物的本相。
科学不能解释的实在是太多太多，尤其是对于心灵的秘密就更是如盲如哑。因此在世界上的科学家通过比较研究也得出了佛教是非常了不起的结论，根据今
日中国出版社出版的《三千大千世界—关于佛教宇宙观的对话》一书中所说，十六世纪的伟大科学家伽利略、经典力学的创始人牛顿、相对论的创始人爱因斯坦、著名动物学家阿加西斯等人都是虔诚信仰宗教的，在中国有物理学家黄念祖也是虔诚的佛教徒，电学家王季同笃信佛教，并著有《佛法与科学的比较研究》一书，另外有日本著名科学家松下真一，曾在德国汉堡国立理论物理研究所从事统一场论等研究工作达十余年，也著有《法华经与核子物理学》一书以盛赞佛教，又有西方著名物理学家卡普拉也著有关于《华严经》和现代物理学理论相比较研究方面的论著。
生物进化论与生命流转
科学上的许多理论和学说都是带有很大的局限性。比如人们在考察地球上生存的各种各样千奇百怪的生命世界时，发现这些不同的生命虽然有千变万化的外部形态和内部结构，但彼此间却又具有很大的相似性，只不过复杂与精巧程度不同而已。于是人们为了便于研究，就根据这种相似性而把生物分成不同的种类属相。后来人们在进一步思考这些千奇百怪的生物到底是从哪里来的，它们之间彼此又有何联系时，针对这些问题的回答，达尔文于十九世纪末提出了生物进化论，他主要根据不同物种间解剖学特征如前肢骨节的比较，假设‘一个物种是从与其前肢骨节相近的另一物种进化而来’，并且物种遵循‘自然选择，适者生存’的竞争原则，不断地从简单到复杂，从低级到高级发展演化。
显然，这种进化理论是仅局限于人的感官所能及的范围内，即只是针对我们地球上人类所能耳闻目睹的生命类别，通过进行外部现象的表层观察与归纳假设，所提出的一种十分不完善的理论。所以这种理论也像科学上的其他许多理论一样，不断地被后人修正和否定，比如近代由于分子生物学的发展，人们又根据不同物种中，具同一功能的基因其结构相近程度，提出了新的分子进化理论，否定了达尔文根据生物之间不同的解剖学特征所归纳出的物种进化顺序。但这种新的进化理论同样是不究竟的，它也仅触及生命的表层现象，而没有深入到生命最深层的本质，所以同样会被以后的理论所推翻。
生命问题是现代科学的重大课题，同样，它也是佛教的关怀所在。释迦牟尼佛因悲愍众生而发愿让一切众生离苦得乐，为彻底明了生命的本质，通过往昔长劫勇猛地修习菩萨的六度万行，最后证得了最圆满的智慧。所以佛家的动机和起点就是相当高的，故佛陀无所不知的智慧眼里能洞见十方无穷的世界，现见有情世界的种类不仅限于地球上的动物和人类，而是遍于虚空界的整个六道众生，并且指出不单是每一个有情根据自己不同的善恶业而于六道中不断地升进和沉沦，而且人类社会也是依据人们共同所造的善恶业而兴盛发展或退堕衰败。比如从佛经中描写的人类历史来看，当人们行善的时候，身高寿命皆普遍增长，人寿可增至八万四千岁，其福德几乎与天等同；而人们行恶时，则福德日减，灾害渐多，内心烦恼痛苦也剧烈增盛，比如人寿减至只有十岁时，人类身高也仅为一尺，社会上饥馑、瘟疫、战争等灾害普遍流行，人的生活相当于动物一样。并且佛陀更进一步指出，从本质上讲，这一切外部现象与内心的苦乐诸种感受，皆是因为众生的无明我执的妄心所生，如佛经云：‘众生从业生，心断业非有。’
达尔文的生物进化论，只是从生物的外表形态与结构出发，而没有深入到有情世界内心的奥妙，于是得出生物和人类的进化是遵循著“自然选择，适者生存‘的竞争原则。这一错误的结论，结果导向人类有意或无意中走向凶暴与自我毁灭的道路。比如，人与自然动物竞争的结果是自然界中的土地、大气和水受到了严重的污染，人类的生存环境遭到重大的威胁，比如在欧洲，著名的河流莱茵河中已鉴别出近30余种的有害物质，河流中的鱼虾近乎绝迹。人与人竞争的结果，是个人和国家的安全感都在日益地减少，人类随时都可能遭受全部毁灭。所以，在同自然和社会的适应过程中，科学虽然想给人类带来福乐，但由于不知道内心世界的奥秘，最终还是适得其反，如佛教中著名论典《入菩萨行论》所说：’若不知此心，奥秘法中尊，虽避苦求乐，无义终飘泊。‘
科学由于自身的缺陷，给人类社会带来了许多的弊端，现在许多有识之士越来越认识到这一点。而佛陀的智慧包含过去、现在、未来的一切时间和十方无尽空间，生命和宇宙的本质均无余现前，故有西方许多的科学信徒也都纷纷到佛教这块圣地来寻求有关指明宇宙、人类社会发展方向的真谛。比如1999年5月至6月，包括有16个国家（其中美国最多，其次为瑞士、德国、法国、加拿大、英国、意大利、澳大利亚、日本、印度、荷兰、西班牙、葡萄牙、新西兰、墨西哥、越南）的182位以欧美佛教徒为主体的大型佛教访华团来中国参访学佛，他们说：西方人对物质的追求已有好几个世纪了，但科技的发展并不能解决人们的很多问题，相反，造成人们对现实的迷茫、精神空虚，他们认识到东方文化尤其是佛教有著深邃而珍贵的精神财富，西方人仅在西方学佛还不够，这次就是专门到中国来学习佛法的。
世界上最大的谜是什么
现在的科学在探索研究外部物质世界的同时，也发现了某些规律，解开了一部分自然之谜，但是世界上万事万物的奥秘是无穷无尽，科学家何时何日才能解开这一切所有的谜呢？！其实一旦把其中最根本最重要的谜底解开，这所有一切都自然迎刃而解了。这宇宙无穷无尽个谜中最大之谜就是‘