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过了十几天，圣旨终于到了。听了太监的宣读，跪听的刘纯惊呆了；直至儿子们提醒他，他才接旨谢恩。真是皇恩浩荡，永乐皇帝朱棣不但不怪罪他，反而根据永乐皇后徐仪华的遗愿，下旨命令刘纯，在南京的诏狱中，使用前朝官员和家属，以及其它犯人进行试验；主要目的，就是研究乳岩的防治问题。让刘纯感动的是，朱棣还说所需费用和医官，均由太医院配给。还让刘纯感动的是，朱棣还说要他兼任锦衣卫指挥同知。更让刘纯感动的是，朱棣说这个试验的开始和结束日期，让他自己决定。刘纯一下子感觉朱棣，好像还是当初的燕王，能够跟他称兄道弟。多少年来，虽说表姐夫朱棣当了皇帝之后，以赞襄军功封他为世袭安亭侯，两家又成了亲家；可是他见了朱棣，总有一种伴君如伴虎的感觉。
不过兴奋之余，他也隐约觉察出，这道圣旨是含糊不清的。这个太医院的院使还当不当呢？看来永乐皇帝朱棣是让他自己提出辞职！因为让他去搞试验，就意味着离开了太医院；离开了太医院，怎么能够领导太医呢？看来这是一种体面的处分。因为任何一个太医把皇族治死了，要首先被太医院的院使给予处分；然后才是听候皇帝的处分。这是朝廷的规矩。刘纯就是太医院的院使，自然要接受皇帝的处分。转念一想，离开太医院不是一件坏事，因为许多病不好治；而且太医们勾心斗角，把人治好了都去争功，治不好就互相看热闹。现在不是吗，有的太医总是打听皇帝的意图，巴不得让自己的长官刘纯受处分。可是这个乳岩到底应当怎么治，太医们谁也不敢插嘴。看来搞点试验还是应该的。想到这里，他又觉得朱棣很英明。不是吗，自己也怀疑沙鱼胆治疗乳岩的疗效；而且为什么要发生乳岩呢？乳岩为什么要发生流注呢？乳岩为什么要死人呢？还有其它一些问题也是相当糊涂的。因此搞试验是非常必要的。
刘纯写了谢恩折子，就把太医们找来商量。怎样搞这些试验呢？当然，大家都说皇帝的决定是圣明的，可是从哪里入手呢？太医们当场写了几百个问题，看来热情很高；但是谁来参加这个试验呢？太医们个个摇脑袋。刘纯很生气，不过他理解太医们的心情，拿犯人做试验，毕竟不是一件光彩的事；还是要有一个正大光明的名义！于是他又给永乐皇帝朱棣写折子，要求成立一个对外号称编修大明医典的机构。折子很快就批下来了，朱棣照准，并且免去了他的太医院院使，改任大明医典编修使，还是正二品官员。可是太医院还是不调派医官。怎么办呢？他决定找好朋友道衍和尚想想办法。
道衍和尚也是永乐皇帝朱棣的好朋友，已经被朱棣赐名＇姚广孝＇了，而且当了正三品的太子少师。开国皇帝朱元璋信佛。他给每个儿子配备了一个和尚，初衷是教育儿子信佛；可是道衍和尚却帮助四儿子朱棣发动了政变，这是朱元璋始料不及的。刘纯见了姚广孝，刚说几句话，姚广孝就说：“你看，我把你的官印都准备好了”。说着就拿出一个硕大的印鉴来。这方28×15×15厘米的大印，原来是元朝皇帝赐给西藏花教，象征权力的官印。元朝灭亡之后，西藏黄教取代了花教，就把旧官印缴还给明朝政府。前几天，朱棣把这颗方印赐给了姚广孝；姚广孝看了看，说不如给刘纯当官印，因为刘纯信仰小乘教。朱棣笑了，说：“听卿的！听卿的！”
刘纯谢了姚广孝，刚要张嘴说话；姚广孝又说：“我是你肚子里的蛔虫，我知道你想说什么。你现在没有衙门，没有啰啰兵，对不对？”刘纯急着说：“着啊！” 姚广孝笑着说：“我告诉你，周王那里编完了＇普济方＇，留下一帮子医官没有地方打发，也急得团团转；你接过来就是了。”于是两个人一块儿去河南，找皇帝的弟弟周王朱橚。朱橚也因为＇普济方＇受到许多名医的指责而莫名其妙，巴不得把指责弄清楚。听说刘纯要深入研究，朱橚非常支持，于是一谈即成。编写＇普济方＇的医官全部交给了刘纯。于是刘纯在南京太医院的大门口，挂上了＇钦命大明医典编修使＇的牌子，开始办公了。
右下角的洞门是狗洞吗？不，这是山西省洪洞县的古代死囚牢。是中国大陆仅存的一座明朝监狱。死囚犯要从洞门爬进去。洞穴里没有窗户，黑洞洞不见光线。京剧＇玉堂春＇里的苏三起解，说的就是苏三从洞门里爬出来，去太原市接受复审。因此古代一个人，一旦被宣布是死囚犯，就立即变成了狗。
以囚试医奇怪吗？不奇怪。因为明朝的死囚犯及其家属没有人权。
比如，为了整肃吏治，明朝开国皇帝朱元璋，在1371年规定，无论官大官小，只要贪污60两银子，一律判处死刑。这种死囚犯不仅要砍头，而且还要被剥皮。当时各个府、州、县的土地庙就是剥皮场；而且在官府大堂的公座旁边，就摆着人皮囊。但是死囚犯被剥了皮，其家属是无权抗议的。
又如，为了研究武器，明朝景泰皇帝朱祁钰，曾经下旨让神机营使用死囚犯做试验，研究先进的火炮、火铳；许多死囚犯被炸死炸伤。但是火炮、火铳的威力得到不断提高。因此在1449年，兵部尚书于谦在指挥北京保卫战的时候，明军神机营的火炮、火铳发挥了巨大威力，把蒙古军队打得潰不成军，甚至蒙古军队的铁元帅孛罗卯那孩，也被火炮击毙。但是死囚犯被炸死炸伤，其家属是无权抗议的。
再如，为了刑侦取证，明朝的大明律规定，可以使用死囚犯做试验。明朝成化年间，江西省铅山县有一个砍柴人爱吃黄鳝。有一天，他吃完妻子做的黄鳝之后，突然肚子疼，挣扎了一会儿就死了。邻居怀疑是砍柴人妻子投毒，就把她扭送县衙。砍柴人妻子不承认，而且验尸也没有投毒的证据。这怎么断案呢？县官张昺怀疑是黄鳝中毒。然而谁也没听说黄鳝有毒。怎么办呢？根据砍柴人妻子描述的黄鳝的产地和形状，县官张昺让渔民捕来同样的黄鳝，让砍柴人妻子当场烹调。然后提出一名死囚犯，当场把黄鳝吃掉。结果，死囚犯吃完黄鳝之后，突然肚子疼，挣扎了一会儿就死了。于是县官张昺判决砍柴人妻子无罪。但是死囚犯提前死亡，其家属是无权抗议的。
因此古代的死囚犯，尤其是明朝的死囚犯，其处境是十分悲惨的。且不说为什么被定罪。但是这个人一旦被判处死刑，即便是宣布秋后处决，也可能被随时处死，或者当了试验品，以及瘐死狱中。这是非常不人道的，然而历史就是如此。
中医的许多经验，本来就是拿人试出来的。
比如，上古的炎帝神农氏，曾经日尝百毒，记录了许多食物和药物的性能。又如，明朝的李时珍根据病人的吃药反应，编写了＇本草纲目＇。李时珍，字东璧，号濒湖老人。生于1518年，卒于1593年，享年75岁。湖北蕲春人。1556年担任明朝嘉靖太医院院判，一年后辞职回乡。＇本草纲目＇是他花费27年功夫编写而成。书中记载了药用植物1195种，药用动物340种，药用矿物357种。处方11096个，插图1110幅。1596年，其子李建元，给明朝万历皇帝朱翊钧写折子：“湖广黄州府儒学增广生员李建元谨奏。臣故父遗书刊行。伏望圣鉴。大明万历二十四年十一月十八日进呈。”御批：“即奉圣旨钦此”于是＇本草纲目＇在留都南京，由官方出版发行。1606年首先传入日本，以后又流传世界各地。再如，古今的许多中医为了给人治病，经常拿自己当试验品。
然而西医的许多治病方法，只是试管的产物。这就是中医与西医的不同。
以囚试医，应当从哪里入手呢？刘纯认为应当从辨证施治入手！因为中医不是根据病名，而是根据证候群看病。因此尽管病名有千万个，但是证候群只有16个。
因为辨证施治是中医的最基本的指导思想；如果指导思想不清楚，那么就会一步错百步歪，整个试验过程就是混乱的。辨证的证是证侯群；证侯群是疾病的病理，是疾病的本质问题。那么人类的疾病到底有多少个证侯群呢？内经的病机是十九条，刘完素又新增了一条，也就是说证侯群只有20个。但是有些医生把辨证施治理解为对症治疗了。因此把证侯群随便划分为几百个，甚至无数个，这显然是胡编乱造了。编写＇普济方＇的医官都是当代名医