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（一）刹那灭：即种子本身是刹那生灭的，所谓刹那生灭，就是才生即灭，灭已即生。一期生灭，如人之生与死，我们可以看到，而一刹那的生灭过程，不是我们所能见到的。本来任何一种东西，都是时时刻刻在那里生灭变动，但是我们看不见他动，因为它那即生即灭的速度很快，很微细的。一件事物，所以要变坏，终归之无常，就是因为它本身时刻在变动着，在生灭着；否则，没有生灭相，则事物就会常住不坏了。换句话说，人就永远不会老，也不会死了。种子是有为性，故它本身的条件，要刹那生灭。假如不是刹那生灭，则不能起变化作用。其次，种子必具特胜功能性，以生起自果，如谷种子若不能变为芽，那就不成为种子了。此遮大众部等立无为缘起，正量部立长时四相，又外道以自性神我等为诸法因，大乘一师以真如为诸法因。《成唯识论》云：
谓体才生，无间必灭，有胜功力，方名种子。此遮常法，常无转变，不可说有能生用故。［11］
（二）果俱有：这是说在现行果法上并没有失去种子的性能，而且二者是不相分离的。如谷种子生了芽茎枝叶花蕊，原在地下的那粒种子虽然坏了，但是种子的性能并不是没有的，种子的功能是和那正在发展的芽茎叶枝等和合为一体。不过你只见是茎叶，而不能见种子罢了。其实，这叶茎枝就是芽种子的扩大，就是芽种子的本身发展。换言之，种子就是芽叶茎的收缩罢了。故种子在这阶段上，和芽茎等是同时现起的，种子的本身决未消失。心识外的种子与现行法如此，我们人生的现行业果和能招感的业种子的关系也是如此的，所以说现行与种子是和合不分的。现在人身生命是现行法，此生命是由过去的业种子而招感的。这业种子的功能，在入母胎时，种子就渐渐变化成为现行法。变的时间即是渐渐地增长，渐渐地长大，就是种子现行同时义。即是说明要种子望于现行果，不是同类法，互不相违，能在一身中，有俱时现在能生的作用。此遮经量部等因果异时；又外道计执从他身大自在天生一切有情等。然而，就此种子生现行论，若种子自类相生，无畏俱有义。《成唯识论》云：
谓与所生现行果法，俱现和合，方成种子。此遮前后及定相离，现种异类互不相违。一身俱时有能生用，非如种子自类相生，前后相违，必不俱有。虽因与果有俱不俱。而现在时可有因用。未生已灭无自体故。依生现果立种子名，不依引故，但应说与果俱有。［12］
（三）恒随转：这说明种子随现行法的时间性。谓种子要长时一类相续，无转易，无间断。然而诸法中恒时相续者，唯第八阿赖耶识。所以要恒时随此能持的第八识转起，一类相续，方为种子。即种子随现行法转变与现行法一类相续，至究竟位。在外种上说，就是要结成果实的时候为止。在内种现行上说，就是至招感异熟报尽的时候为止，或说至对治道生起时，才是究竟位。依无漏道说，就是要成佛的时候，方名究竟道。此遮七转识及色法，转易间断，不得为种子。《成唯识论》云：
谓要长时一类相续，至究竟位，方成种子。此遮转识，转易间断与种子法不相应故。此显种子自类相生。［13］
（四）性决定：这是说明种子有类性的差别点。谓种子要随其能熏因力的善恶等性各别决定，从此物种子还生此物。即善种子决定生起善的现行，恶种子决定生起恶的现行，不相杂乱。明显地说，就是种子能熏的现行因是善，种子所生的现行果必定是善；能熏的现行因是恶，所生的现行果必定是恶。也就是说，善性种子为善因，感乐的果报，这性质是决定的，恶性种子，亦复如是。此遮小乘有部等说善、恶、无记等为同类因。《成唯识论》云：
谓随因力生善恶等，功能决定，方成种子。此遮余部执异性因，生异性果，有因缘义。［14］
（五）待众缘：即是种子藏在第八识中而不生，因为种子必须要有很多条件来帮助才发生作用。也就是说，种子要待众缘和合，种子转变，方能生起现行果。如《成唯识论述记》云：
谓自种子，要待众缘和合，种子转变，起取现行等诸果作用，功能殊胜，方成种子。故种自类非因缘合，不名种子。［15］
此遮外道执不待众缘，从自然一因顿生结果等。又小乘有部等执缘体恒有。《成唯识论》云：
谓此要待自众缘和合，功能殊胜，方成种子。此遮外道执自然因，不待众缘恒顿生果。或遮余部缘恒非无。显所待缘非恒有性，故种于果非恒顿生。［16］
（六）引自果：谓种子要各自引生其色心自果。即色法种子，唯能引生色法现行；心法种子，唯能引生心法现行。如《成唯识论述记》云：
“谓于别色别心等果，各自引生，方名种子。非善等色种，生善等心果，可名种子，不相应故。”［17］
从这一点上说，一切法的生起是从各自的种子而生自果，决无有一因生一切果，如上帝造万物之学说。此遮外道执一因生一切果，又小乘有部等执色心等互为因缘。具有这六种义的种子，而摄持在第八识中。故《成唯识论》云：“唯本识中功能差别，具斯六义、成种、非余。外谷麦等种，识所变故，假立种名，非实种子。”［18］这是简别外法种子，非是宇宙本体。因此说，若不具此六义，就不能做为现行果法亲因缘种子的资格。所以，这六义说明了种子的体性。
四、种子的种类
种子的种类，即有二种：一有漏色心种子；二无漏色心种子。所谓有漏色心种子者，又有二种：一名言种子；二业种子。
（一）名言种子者：即由名言所熏能引生一切善恶诸法自果之各别亲因缘种子。此种子随能熏的现行，又成二种：一表义名言种子；二显境名言种子。（1）表义名言种子者：即能诠表义理之名句文字等。就是第六识缘诠表诸法义理之名言，熏成五蕴三性等差别种子，故曰表义名言种子。又即能缘心缘所缘境时，自发名言，诠显色心诸法，于自心前，变现彼诸法之相分，熏彼诸法之种子于阿赖耶识。或闻他名言所诠色心诸法，于自心前，变现彼相分熏彼种子于阿赖耶识。（2）显境名言种子者：即能了别境界之心心所法。就是一切心心所法缘各自境时，不因自他之名言熏成种子，谓之显境名言种子。即一切七识见分等心了别诸境时，变现彼诸境之相分于心前，熏彼种子于阿赖耶识。此乃由见闻觉知的作用所熏种子，实不因名言，然能缘心能显所了镜恰如名言能显所诠诸法的体义；所以，喻名此见分等为显镜名言。
（二）业种子者：业者造作义，谓由造作善恶等业所熏种子。于第六识相应里心所，依身、口、意三造作善恶等业，熏自思心所种子于阿赖耶识。而此思心所的种子，有二功能：一、生自思心所现行功能，名为名言种子，不名业种子。二、助他羸劣无记名言种子令生现行功能，名业种子，不名名言种子。即无记名言种子，性羸劣故，无自生起现行果的力用，必藉善恶名言种子的助缘，才能生起现行果。所以善恶名言种子，不唯能生起自果，又有助他无记种子，令生果的功能。此其生自果边，仍名为名言种子。于助他无记种子令生果边，立业种子名，非别有体。所以说，名言种子通于八识，并通于三性。而业种子局限于第六识思心所，而且唯局善恶二性。无记羸劣，无助他的功能。又思心所兼名言、业种二种功能，他心心所但有名言种子之功能。
种子者，亦名习气。所谓习气者，气者气分，习谓熏习。由彼现行熏习，得此气分，故名习气。所言习气者，现行气分熏习所成，故名习气。即诸法现行时，随应所熏色心诸法的种种习气，皆悉落在第八识，更成彼识后时生果的作用，故名种子，亦名习气。即所谓种子，望所生现行立名。所谓习气，对能熏现行立名。名异同体故。如《成唯识论》中说，习气有三种：一名言习气，二我执习气，三有支习气。
（1）名言习气者：亦名等流习气，谓有漏无漏三性七识缘名言所熏种子。等流，是所生果名；习气，是能生因名。等者相似义，即此种子与果性同。流者流类义，果是彼类。或