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何身根？谓所触为境清净色。 ＇P819＇
文段有五，悉明根义。根者、有由依托乃得生长之义，如草木等，由依托于根故，而干而枝而叶得生起长成也。诸识亦然，各有其根，识方现起。然根有二：谓净色、浮尘。浮尘者，──又名麤色根，或名根依处，浮之于外与尘寰交接，即眼如葡萄朵等之浮根四尘，及身之四肢百骸者是也。净色根者，清净之色不可见而有作用者也。论言五根谓净色根也，为眼等五识之所依止，故云为根。
云何眼根者，征释可知。眼之差别总有五种：一、肉眼，二、天眼，三、慧眼，四、法眼，五、佛眼。此中初二眼色蕴摄──修果名天，报生名肉，故欲天眼唯肉非天，非修果故。五眼皆有通二世及三世等之差别，后三眼非蕴摄，于中慧眼、法眼为二无漏根，佛眼通于前四。今论所明眼根，即肉、天二眼也。此有现行种子差别；界门眼通种子，五根门眼唯取现行，今唯现行也。
色为境、清净色者，广五蕴论曰：『云何眼根，谓以色为境，净色为性，谓于眼中一分净色如净醍醐，此性有故，眼识得生，无即不生』。以色者，是眼所行境 ＇P820＇ ，而能引发根故；谓举能引发境显所发眼自体也。净色者，以净言简扶尘根，显胜义根也。盖扶尘根为有见有对之麤色，此色清净微妙故喻如醍醐。醍醐由熬乳作酪，自酪出酥，熬酥为醍醐，乃酥精液，不可多得，净极甘美故。一分者，简周遍，谓舌身二根净色遍满所依处，眼等三根不尔，故以一分及周遍，显其差别也。此性有故下，示眼识能生相，文显易知。
云何耳根等者，文有二科，初征后释。净色根义，上已略明，今更举释论── 广五蕴论──释之：『根者，最胜自在义、主义、增上义。所言主者，与谁为主？谓眼根与眼识为主，生眼识故；如是乃至身根与身识为主，生身识故』。最胜等三义，成唯识论四、说五识四种依中──一、五色根同境依，二、第六识分别依，三、第七识染净依，四、第八识根本依──同境依，有「依」、「所依」、「有所依」义之别，此五根正为五识之「所依」也。然所依必具四义：一、决定义，谓眼识必依眼根生，无依余根生义。是言决定，简第六识虽以五识为依，然不定故，非决 ＇P821＇ 定义也。二、有境义，谓各自有各自所取境义，如眼根有色境，耳根有声境等。是简四大及五尘、种子等，彼虽有决定义，盖非有境也。三、主义，谓要主而有自在力令余法生义也。是简遍行等，彼虽有决定与有境二义，不能为主令余法生也。四、令心心所取自所缘义，谓受想等皆虽娶自境，不能令他取也。余心心所虽有具一、二，不能并具四义，唯五色根具四，故为所依。今释论中主义者，举其一义影显余三。或可如上四义唯局五根，主一种通一切根，故约总相释根举主一义耳。最胜自在义、增上义者，此二义俱在根上一义，差别开二种，然俱舍唯举此二，不举主义。最胜自在义者，──根体胜故，名为最胜，根用胜故，名为自在。以一根能了别众色义边，名最胜自在。增上义者，随所依根强弱能依识亦明昧义边，为增上义；谓根强能依识明，根弱能依识昧故。若言一义差别开二种，今论何二义中间安「主」义乎？答：今论意显所依根上具以一了多，及随根明昧之二义，虽同有大势用，然尚有余意──见上文四义中所解主义──故于二义中间安立所依主义以尽其旨 ＇P822＇ 耳。谓声为境清净色者，后释也；释中举所取境，显能取根体可知。以上二根取离境，下三根合境取也。俱舍颂云：眼耳意根不至、三──鼻舌身──相违。五根，义林亦曰：『眼耳二根离质用远，离取义增，妙用难测，故别立二通──天眼、天耳──余三根不立耳』。
云何鼻根乃至云何舌根清净色等者，鼻根易知，舌根有异说。释论云：『云何舌根？谓以味为境，净色为性，谓于舌上周遍净色。有说：此于舌上有少不遍如一毛端。此性有故，舌识得生，无即不生』。按：此文初举本论，后释本论，初中征释可知。释论中二：初举所依根，后示能生相。初中复二：初示正义，后举异说。初中周遍者，对上三根一分也。俱舍二曰：『布在舌上形如半月』，是与今论周遍同也。有说下，后辨异说。俱舍对此置言传说以示不信，今论亦尔，故云有说。释此，光记举二说：初说曰：『西方古德相传解云：医方家说：「于舌根中如毛端量，无舌根处，是末磨死节──梵语末磨，此云死节，节者、支节也，是身中死穴， ＇P823＇ 触便致死，颇似神经系或血管等──若针刺着，其人即死。舌中法尔有斯空处』。后说曰：『于人脑中，有臭极秽不净脑垢，若见饮食，脑垢流出，滴此空处。若无此处承此脑垢，触着舌根，令人呕吐不能饮食』。是性有故下，后释舌识能生相可知。
云何身根等者，释论云：『以触为境，净色为性。谓于身中色周遍净色，此性有故身识得生，无即不生』。释曰：第五明身根中二：初本论，后释论，初中征释二可知。以触者，触有二：能触、所触也。所触中亦二：谓能造大种，及所造触尘也。所造触尘有二十二种差别：所谓滑、涩、轻、重等也，至下可辨。此中即举滑、涩等所触境以显能触身根也。谓于下，后释论。此文亦明根体与识能生相，二科如前可知。上来正释五根已竟。
问：净色简粗色，净色即根耶？答：否！净色可以为根，非净色即根。上曾言之，根增上义，对缘境有发识之殊胜功能故，如眼净色对色尘有能生起了别青黄之 ＇P824＇ 识之功能。耳、鼻、舌、身，如应当知亦尔。问：净色根以极微细故，名无见有对，然用今世所新发明显微镜或可能见之耶？答：此乃藉光线增大其功用，虽较前为精明，然犹为上文所明五眼中之肉眼所摄，净色为天眼所见，于天眼中尚非外道五通之天眼能及──佛菩萨天眼能见──况肉眼乎？问：然则吾人无从捉摸耶？答：近今生理学家之神经可以仿佛，日人曾发明之，然谛审观察之，亦不可执定即是。何则？彼生理学家所谓神经者，不外二种：一、丝丝之纤维神经，二、圆圆之细胞神经；此二各有粗细之别，粗者可见，细者虽不可见，然以显微镜瞩之即能了了分明，由是则未可妄为判断以乱真理也。
问：五根一体耶？异体耶？答：有谓是一体，而实不然；各自有各自种子故。又若是一体，眼根有损应能视，耳根有损应能听，而事实上若胜义，若扶尘，随损其一，即失其功用，如瞽盲者等是。又释论言「周遍」、「一分」，亦可见其端倪，倘非异体，焉有此别乎？ ＇P825＇
问：人之死时，转识先没，第八后舍，彼此依根既是异体，其失应亦如识之有次第耶？答：识亡根即失其为根，固有钩锁之关；然此根为色法，由第八识执持，识舍则坏，无所谓去来。但坏时──唯限五色根，七八识根，剎那生灭，相续不断 ──有顿有渐：顿者、随死随坏，渐者、一日乃至七日。于此有人遂误认为中阴身者，是未能晓其真相也。
问：眼根依眼依处，耳根依耳根处，乃至身根依身依处，五根既同是各依各之依处，然身根──、舌根，何竟独周遍，其理由安在欤？答：眼之珠捏之能知，耳之朵提之能识，鼻之峰纠之能晓，舌之端刮之能觉，乃至暖、冷、轻、软、硬、涩，曷非身根之感触；其周遍也，不亦宜乎？舌根以味为境，全舌根依处皆能尝味发了别之识，不同眼耳等依处之膜等不能发见色闻声之了别，故舌根亦遍依处也。
问：识所依根，总有二种：谓共依不共依；然究竟何者为共，何者为不共耶？愿闻其详。答：五识共依──即俱有依有四种：一、五色根，是同境依，即今论所 ＇P826＇ 明清净色根也。二、第六识是分别依，五识随时皆有，如定中闻声等，不无意识。非耳识独起闻者，尔时定中五识先已灭故。世亲摄论第四云：『五识以意为依，意散乱时五不生故』。谓五识其性钝，无明了用，任运缘境不起分别了知，故依第六明了。三、第七识是染净依，成唯识疏曰：『由有第七识染故，施等善法不成无漏』。乃至广说谓恒与四惑相应故，被染诸识成有漏善污法也。四、第八识是根本依，楞伽经伽他曰：『阿赖耶为依，故有末那转，依止心及意，余转识──第六及前五识──得生』�