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（卯）三释自然因缘疑。
问曰。心显成智者。为无明尽故，自然是智。为更别有因缘。答曰。此心在染之时，本具福智二种之性不少一法。与佛无异。但为无明染法所覆故，不得显用。后得福智二种净业所熏，故染法都尽。然此净业除染之时，即能显彼二性，令成事用。所谓相好，依报一切智等。智体自是真心性照之能。智用由熏成也。
问者不了平等差别之义，乃是即平等起差别。即差别见平等。故谓之常平等常差别耳。以不了此义故。遂计常平等句，以为自然。计常差别句，以为因缘。因举前释净心自觉之文，以兴问端。曰。前所谓心显成智者。为无明种子等尽坏之故，由于其心本具有自然之智耶。若自然者，何谓缘起差别。则常差别义不成，为更别有熏习因缘，方能无明尽坏而成智耶。若因缘者，何谓心体平等。则常平等义不成。答中乃双破二计，令得融会。如云。本具福智二性，与佛无异。及显彼二性，令成事用，所谓相好依报等。则非因缘也。此显心体常平等义。又云。但为染法所覆，不得显用。及福智二净业熏令染尽而后能显。则非自然也。此显缘起常差别义。由此可知。虽本具而为染覆，非熏不显。所以常平等常差别。虽为染覆，非熏不显，而实本具。所以常差别常平等也。末二句结辞。若知体是性具。用由熏成。则平等起差别之义明矣。若知用虽熏成。体本性具。则差别见平等之义明矣。此义既明，自然因缘二计自破也。○自性本具之福德性，能成报身佛。智慧性，能成智慧佛及应身佛。福慧二种净业者。如世间功德福业也。三宝功德，则福慧兼具。其中若印造经像，修庙供僧等福业偏多。闻法看教，慧业偏多。相好光明正报也。国土庄严依报也。此二约福德言。一切智等，约慧业言也。所谓见思惑尽，成一切智。即无师智。尘沙惑尽，成道种智。即自然智。无明惑尽，成一切种智。即无碍智也。
（卯）四释无明心性疑。
问曰。心显成智，即以心为佛性。心起不觉，亦应以心为无明性。答曰。若就法性之义论之。亦得为无明性也。是故经言。明与无明其性无二。无二之性，即是实性也。
问者至此，前疑虽释。复疑智固心显，无明亦由心起。则以心为佛性固可。若以心为无明性，应无不可。答谓。若偏就心法之性而论，亦得谓心为无明性。因引楞伽经，证其无二。无二者。譬如水之与冰，言相固不一。言性即不异。何以故。同一湿性故。是故智与不觉，言相固不一。言性则不异。何以故。同一心性故。无二之性即是实性二句，犹言性实无二。然则何故独说有佛性，不说有无明性。说有佛性者。令众喜乐，发心修证故。若说有无明性。令众沮丧，毫无利益故。吾人闻性实无二之说。便当转无明以成智，不可认无明即是智。例如水冰之性无二。应知冰销即可成水，不可迷水而认其冰也。已上释佛性竟。（校上来原本卷四竟。）
（子）四释法身。
问曰。云何名此心以为法身。答曰。法以功能为义。身以依止为义。以此心体有随染之用，故为一切染法之所熏习。即以此心随染故，能摄持熏习之气。复能依熏显现染法。即此心性能持能现二种功能，及所持所现二种染法，皆依此一心而立。与心不一不异。故名此心以为法身。此能持之功能，与所持之气和合故，名为子时阿赖耶识也。依熏现法之能，与所现之相和合故，名为果报阿赖耶识。此二识，体一用异也。然此阿赖耶中，即有二分。一者染分。即是业与果报之相。二者净分。即是心性及能熏净法，名为净分。以其染性即是净性，更无别法故。由此心性为彼业果染事所依，故说言生死依如来藏。即是法身藏也。又此心体。虽为无量染法所覆，即复具足过恒河沙数无漏性功德法。为无量净业所熏故，此等净性，即能摄持熏习之气。复能依熏显现诸净功德之用。即此恒沙性净功德，及能持能现二种功能，并所持所现二种净用，皆依此一心而立。与心不一不异。故名此心为法身也。
此第四释自性清净心，又名法身之所以也。凡立一名，含义匪一。即各有所取。如法身二字，寻常释法为轨持。谓摄持之轨则也。如长短方圆等。是取体义。释身为积聚。谓积而聚之。如积聚五阴，和合四大等。是取用义。本书以功能释法，则为用义。盖举体起用也。以依止释身，则为体义。盖摄用归体也。此科文长。兹先分出章段，令易体会。自问曰至依止为义，乃标示名义也。自以此心体至显现染法，释功能义。自即此心性至不一不异，释依止义。故名此心以为法身句，结成。此初约染分，以名法身义也。又自此能持之功能，至果报阿赖耶识，明功能之体状也。此二识体一用异句，明依止之体状也。自然此阿赖耶中，至名为净分，为牒染标净明有二分。盖法身一名。含有具足随染随净二种功能，及染净二法皆以此心为所依止之义。以上既明染分，以下须更说净分也。自以其染性，至更无别法故，明此心能随染净及染净皆依一心之所以也。自由此心性，至即是法身藏也，结前染分。兼明如来藏，法身藏，名异实同。自又此心体至功德之用，释功能义。自即此恒沙至不一不异，释依止义。末句结成。此次约净分，以明法身义也。○约染分明功能义中，先明能随。继明能摄。更明能现。以能随故，为染所熏。以能摄故，染法不失。以能现故，染法显现。具此三能，染法成就矣。明依止义中，谓能持能现二种功能，固依一心而立。其所持染熏之气，与所现之染法，亦皆依一心而立。与心不一不异者。盖就心体言，本无能所，故与心不一。而就能所言皆依一心，故与心不异也。此中但举能持能现二种功能不及能随者，以由能随而后有能持，言持则随自见矣。故名此心以为法身句，总结上文。此约染分结法身义。若对净分言，此为在缠之法身。即如如佛也。明功能体状文中，初约能持所持以明体状。能持与所持和合句，言其状也。气字，即上文熏习之气。能持之能，即是心依熏变。所谓能持之功能为因。所持之气为缘。此之因缘和合，即是三细中之业相。亦名业识是也。名为子时阿赖耶识句，出其体也。次约能现所现以明体状。能现与所现合和句，言其状也。能现所现，即所谓妄分能所。为三细中转现二相。本书说为显现虚状是也。名为果报阿赖耶识句，出其体也。此之三细，同以第八识为体。起即俱起。极其微细。故同名阿赖耶识。然对转现言，则业相是因。对业相言，则转现是果。故上名子时。此名果报。然此尚是界外无明。所谓见思细惑。（以其俱名阿赖耶。是专就三细说故也。）由此而生起六粗，则为界内粗惑矣。明依止体状文中此二识，即指子果二阿赖耶识。体一者出体。名虽有二，而同是阿赖耶，故言体一，用异者显状。子阿赖耶能持，果阿赖耶能现，故言用异也。明有二分文中，一者染分下牒染也。业者，业相。果报者，转相现相�