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—16电子计算机程序》，测出了川楝素的衍生物青蒿素的结构，获得中国科学院三等奖。没过多久，他如愿以偿，用“直接试差法”最终完成了川楝素结构的测定。
侯永庚走上讲台，向同行报告他的成果。他神采奕奕，丝毫也看不出开了3天夜“车”的倦意。强烈的阳光直射会场，主持人便将窗帘放下来，侯永庚却因此看不清讲稿了，窗帘又一次被拉开。报告完毕，侯永庚眼前发黑。他摸索着收拢讲稿，勉强靠自己走下楼梯。
文学家说过，眼睛是心灵的窗户。从1980年7月起，侯永庚的心灵之窗因糖尿病永远地关闭了，多彩的世界，亲人的笑靥，都成为永恒的记忆。
不幸，在爱中化解
科学研究证明，人们从外界获得的全部信息中，80％以上来自视觉。失明之后的侯永庚不愿成为家人的负担，他要学会生活自理。
凭着感觉，他“刺”的一声划着了火柴，左手摸索着拧开煤气灶旋钮，右手在想象中靠近灶眼。几秒后，他的手指感到火焰的灼痛。一根、二根、三根，不知划到第几根火柴，他终于听到了“卟”的一声，火，终于点着了。
然而，一股焦糊味扑鼻而来，脚边热烘烘的。不好！这是扔掉的火柴余烬点燃了簸箕里的废纸杂物。他慌忙用脚踩，用水泼。
李立璞下班回来，见家中一片狼藉、忍不住发几句火，脸上却流下一行心酸泪。那声音，老侯听见了，这泪，他却看不见。
侯永庚感到了生活的严酷。他不想再连累妻子和儿子。她用爱情的力量把他从黄泉路上拉了回来。她正值中年，如果没有他这个“包袱”，她在事业上可以做出更骄人的成绩。他真诚而又违心地向妻子提出离婚的要求。
李立璞哭了，哭得很伤心。她把一切都给了这个男人，他已经成了她生命的一部分，在他身陷绝境时，她怎么能扔下他不管呢？她知道，永庚是爱她才提出离婚的。她也清楚，他一旦下了这个决心，靠自己一个人已很难说服他。
李立璞找来了单位的领导，由组织出面，批评了他。当着大家的面，李立璞对侯永庚说：“我的两只眼，有你一只。你今后要再提离婚就是有意伤我的心！”爱的誓言和着泪水、怨艾和期待，抚平了侯永庚心中绝望的波涛。
应了一位意大利作家的名言，“真正的爱情能够鼓舞人，唤醒他内心沉睡着的力量和潜藏着的才能”，侯永庚迅速地获得了重新生活的能力。他学会了洗碗、洗菜、洗衣服，当然，点火做饭是绝对被禁止的。每天早晨6时，他准时起床，洗10分钟冷水浴，到走廊上爬楼梯锻炼身体，早饭前，由李立璞为他注射胰岛素。他在家里每天像政常人一样工作8小时，晚上常常在加班中度过。乐观而好强的李立璞不仅包揽了全部家务，本职工作照样干得出色，她主持的核磁共振小组连年被评为先进集体，她本人当选过先进个人、优秀党员。现在，她已是副研究员，还担任了全国波谱学委员会委员、北京理化学会理事的职务。
他们的儿子，从6岁起就学会了给爸爸打针（这需要的不仅是孩子的胆量，而且是全家人的勇气）。前几年，所里还没为老侯配计算机时，侯永庚上机计算都是到外单位，利用人家的空闲时间，有时是晚上，有时是星期天。因为家里没有电话，每次都是先由李立璞骑车去“挂号”，然后，儿子领着爸爸步行去上计算机。爸爸、妈妈在机上操作，他乖乖地在一边做作业。望着这一家人，机房的人感动得眼眶发潮，有时就延长机时或减收机时费，表示对他们的敬意。
黑暗中的求索
夜阑人静。李立璞还在为侯永庚朗读文献。为了赶走瞌睡，她从沙发上挪到小木凳上。
“……LTA——逗号——SDEB——括号完了——KMA——斜杠——SPM——斜杠——ISYRE——逗号——QBSC——逗号……”
录音机吃力地转动着，在它之前，主人已用坏了4台。桌子上、书柜里拥挤着近百盘磁带。侯永庚全神贯注，像是要把他听到的每一个字符都咀嚼着吞下去。
失明后，侯永庚的工作方式是听和想。他的每篇论文，都是逐句口述、录制，由李立璞整理成文再读给他听。他再用录音机逐句修改，每篇论文都要经过语言——文字的多次转换。有时，他躺在床上，让思维在晶体的世界中遨游。静卧时脑细胞活跃，加上安静的环境，很容易产生灵感。
他原本就没有什么业余爱好，失明后，长进间收听各种知识讲座，成了他学习和休息的主要方式。有一次，他在广播中听系统论讲座，心头一亮：何不用系统论的方法改造直接法，找到一条适合所有分子结构的晶体测定方法呢？他把进一步研究的计划告诉了导师唐有祺。老师大加赞赏，感慨道：“明眼人没能看清科学的道路，你这个没眼的人却看清楚了！你少了一双眼，思想却比人多了一维。”
在实现系统试差法研究的关键时刻，侯永庚得到了一个叫高敏的青年的帮助。高敏是位研究生，在等待出国签证的一年里，他不去电子一条街上挣大钱，自愿给侯永庚当助手。高敏是这样描述侯永庚的工作的：“侯老师计划将大型计算机上运行的程度移植到化学所的VAX计算机工作站上，并对程度作大手术，即在位相解中使用随机位相起始套，这是一个很重要的改进，它奠定了解大分子结构的基础……侯老师能记住大量的程序内容，强记大量的数据，并把我每次的汇报牢记在心，重要的内容还要录在磁带上以免忘掉。”
1990年5月，正当科研工作进展顺利，儿子紧张准备高考之时，侯永庚被医院初步诊断为肝癌。阴云再次笼罩着这个有太多不幸的家庭。侯永庚感到了生命的短促。他对妻子说：“这次看来躲不过了。我只有两件事放心不下：一是系统试差法还没最后完成，我要用剩下的时间赶快搞出来，总得给后人留下点什么。二是想看到儿子考上大学。假如我提前去了，这就算我的遗愿吧！”
李立璞接受不了这个现实。她围着医生转，找了这个找那个。许是上苍不忍再给这家人增添不幸了，医院最后确诊他得的是海绵状血管瘤，一场虚惊总算过去了。
在一年一度的总结会上，所领导、所学术委员会成员都怀着复杂的心情聆听侯永庚口述《测定晶体结构的系统试差法的研究》论文。
侯永庚宏亮的声音震撼着会场上每个人的心，有的人感动得流下眼泪。
在侯永庚工作紧张的这两年里，侯永庚的岳母特地从上海来北京，包揽了女儿的大部分家务。听说他们的工作得到了大家的公认，这位八旬老人禁不住老泪纵横：“永庚，你真不容易啊！”
没有段落的人生
系统试差法取得重要成果，儿子也早已考上了北京航空航天大学，现在还成了父亲的计算机操作员和翻译，侯永庚的两个“遗愿”总算全部实现了，他现在可以“告一段落”了吧？
不，侯永庚没有给自己丝毫的喘息机会，他的目标不是在某些方面国际领先，而是要对直接法进行全面突破。他计划：1994年，用改进的程序对不对称单元含800以上非氢原子的转移核糖核酸酶RNASE进行骨架模型测定。以此为基础，借鉴国内外的有关程度，写成对RNASE晶体结构的重新测定。1995年：与外单位协作，对未知的不对称单元含1000个左右非氢原子的生物大分子进行结构测定。对新研制的程序进行提高自动化水平的研究，并移植到PC机及兼容机上……
侯永庚是不幸的，但他又是幸运的。执著使他坠入黑暗，冥冥中他却更执著地追求光明。他眼前一片漆黑，却生活在充满阳光的家庭。他足不出户，却与时代紧密相连，与常人平等地交流。他生活清贫，却饱尝同志的温暖，享受着情感的富有。
从1986年起，他得到了国家自然科学基金、北京大学国家动态和稳态分子结构开放实验室基金、化学所所长基金和中国科学院大型仪器功能开发基金总共17。2万元的资助。
多少年了，侯永庚的导师傅亨老人，仍然关心着学生的工作。听到他与沃夫森合作的消息，傅亨马上写信给予鼓励，说：“这样您多年努力的成果可以很快地为世人所知，也是中国人对世界的贡献。”国内同行、学部委员范海福无保留地为侯永庚提供新的晶体样品。沃夫森也从遥远的英伦寄来磁带，那上面录有宝贵的科学数据。
侯永庚是共产党员，每逢组织生活